| HSM | Token |
| Ký số tập trung, người dùng không phải mang thiết bị ký số như USB Token. | Ký số theo mô hình phân tán tại Client. Người dùng bắt buộc phải mang theo thiết bị bên mình. |
| Nhiều bộ phận thực hiện ký số cùng lúc, phân quyền sử dụng cho các bộ phận liên quan dễ dàng. | Tại một thời điểm chỉ có 01 người sử dụng, không thể phân quyền rộng rãi và chi tiết theo từng bộ phận sử dụng. |
| Ký số tốc độ cao & ký đồng thời đảm bảo nguyên tắc số hóa đơn liền dãy – liên tục theo trình tự thời gian, tốc độ lên đến 1500 hóa đơn/giây. | Ký số lần lượt và tốc độ ký chậm, ~ 4-5 hóa đơn/phút. |